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基于隐马尔科夫模型的基因识别系统设计与实现
基于隐马尔科夫模型的基因识别系统设计与实现
刘青;严向东
【期刊名称】《计算机工程与应用》
【年(卷),期】2003(039)024
【摘要】随着基因组研究的发展,利用机器学习方法进行基因识别被广泛使用,这些方法包括神经网络算法、基于规则的方法、决策树、概率推理等.文章描述了一种基于隐马尔科夫模型的基因识别系统,介绍了EM训练算法和Viterbi序列分析算法,该系统运用Burset&Guigo的公共数据集进行测试,核苷识别的Sn和Sp两个参数分别可以达到68%和88%,外显子识别的Sn和Sp参数达到60%和63%.
【总页数】3页(69-71)
【关键词】隐马尔科夫模型基因识别 EM算法 Viterbi算法
【作者】刘青;严向东
【作者单位】华中科技大学计算机学院计算机应用系,武汉,430074;华中科技大学计算机学院计算机应用系,武汉,430074
【正文语种】中文
【中图分类】TP18
【相关文献】
1.基于隐马尔科夫模型的无线传感网络入侵检测系统设计与性能分析[J], 邓小明
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