新手批量下载genbank库FASTA格式序列方法(图文)方法一、直接下载之一
1.1 检索:
1.2 选择检索结果的显示内容,选择FASTA:
1.3 选择显示的条目数:
1.4 “Send to”-“File”:
1.5 保存:
方法二、直接下载之二
2.1 检索到结果以后,将检索结果的显示项改为“GI list”;“Send to”-“File”;显示条目数选择多少都没有影响,默认的是下载全部GI号:
2.2 保存:
2.3 保存到指定文件夹
2.4 进入NCBI的Batch Entrez界面,提交下载的GI号文本文件:
2.5 获取结果:
2.6 有效GI号筛选:
方法三、使用id1_fetch程序后台下载
3.1 如前述下载GI号;
3.2 从https://www.sodocs.net/doc/a516272723.html,/download.html下载id1_fetch,并解压缩到和GI号文本文件同一个文件夹中,例如D:\temp\GI
3.3 Windows“开始”--“运行”键入cmd,进入GI文本文件和id1_fetch程序所在目录,执行命令:>id1_fetch -qf GI文本文件-fmt F ASTA -db Nucleotide -out 输出文件
PS: 高级方法:编写perl,Python,java,C等等程序下载(会编程的都是高手,也不会来看这么初级的东西了。新手若有兴趣请在园子里搜索相关内容)
超级方法:直接拿硬盘去NCBI拷贝