肢带型肌营养不良外显子组测序

中南大学湘雅三医院邓昊教授研究团队与北京诺禾致源合作，

对一个近亲婚育的中国家庭中的一例肢带型肌营养不良患者进行外显子组测序，

鉴定出新的Titin基因致病突变 (c.107788T>C,p.W35930R)；

研究成果发表于2015年9月的Molecular Neurobiology杂志 (IF：5.137) 。

研究背景

肢带型肌营养不良（Limb-girdle muscular dystrophies ，LGMD）是一组遗传模式和临床症

状具高度异质性的常染色体连锁遗传性肌营养不良，发病率约为1/106。

LGMD的遗传模式有显性与隐性遗传，但有半数为散发病例；

而典型的病理特征包括细胞坏死和细胞的再生，伴有不同程度的纤维化和脂肪浸润。

研究结果

1、对一个近亲婚育的中国家庭中的一例肢带型肌营养

不良患者 (V-3) 进行外显子组测序 (图1)，目标外显子

区域覆盖率达到99.70% 。

2、基于测序结果得到编码区/剪接位点上的38,647

个SNV/InDel，通过突变位点筛选和有害性预测得到

61个可能影响蛋白质功能的候选纯合突变。

3、对家系成员的Sanger测序，最终圈定LGMD相关

基因TTN中发现的一个新的纯合突变 (c.107788T>C,

p.W35930R)是该家系的致病突变，此纯合突变与

LGMD2J表型完全共分离 (图2)。

图1 不同测序深度的碱基比例（左）和不同深度上的累积碱基比例（右）

注：横坐标表示测序深度，左图纵坐标表示测序深度为x的碱基在所有碱基中的比例；

右图纵坐标代表测序深度超过x的碱基在所有碱基中的比例。

图2 LGMD2J家系图谱和测序分析结果

a.LGMD2J五代的庞大家系（箭头所示为测序样本）, N normal; M TTN c.107788T>C (p.W35930R) mutation；

b.正常样本的测序结果；

c.杂合子的测序结果 c.107788T>C (p.W35930R) mutation；

d.纯合子的测序结果 c.107788T>C (p.W35930R) mutation

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